核心领域:生物信息学与计算基因组学、病毒转录组学、蛋白质生物信息学、宿主-病原体互作建模、功能基因组学。
主要技术方向:
病毒转录组学与调控信号:病毒mRNA的进化与结构-功能关系研究、病毒转录本中重叠调控信号的识别与解析、内源性病毒对宿主生物学的调控影响;
蛋白质生物信息学与结构分析:N-末端蛋白质分选信号的预测(基于蛋白质组学数据)、膜蛋白家族结构-功能关系、蛋白质晶体接触的理性设计用于提高晶体质量;
宿主-病原体互作与免疫建模:SARS-CoV-2免疫应答的通用建模方法、细菌比较基因组学与代谢通路重构;
个性化癌症网络与功能基因组学:癌症特异性调控网络构建、哺乳动物基因组功能分析与调控系统进化。
关键能力:具备从序列分析、结构预测到系统级调控网络建模的完整计算生物学研发链条,贯通“数据挖掘→算法开发→生物学机制解析→转化应用”的全流程。其学术研究与产业转化(Biomax Informatics AG联合创始人)深度结合,形成了涵盖基础生物学发现与生物信息学工具商业化的综合创新能力。
专家详情:
【重要履历】现任大学生物信息学教授。拥有俄罗斯圣彼得堡电技术大学电物理学硕士学位及圣彼得堡进化生理与生物化学研究所生物化学博士学位,曾在美国海德堡欧洲分子生物学实验室(EMBL)从事博士后研究并获亚历山大·冯·洪堡奖学金,后在德国国家环境与健康研究中心(GSF)担任生物信息学研究所副所长。其学术生涯跨越物理学、生物化学与计算生物学,形成了深厚的交叉学科背景。
【技术能力】集中于生物信息学与计算基因组学。核心方向包括:病毒转录组学(病毒mRNA的进化与结构-功能关系、重叠调控信号、内源性病毒对宿主生物学的影响);蛋白质生物信息学(N-末端蛋白质分选信号的分析与预测、膜蛋白家族的结构-功能关系、蛋白质晶体接触的理性设计);宿主-病原体互作建模(SARS-CoV-2免疫应答的通用建模方法);个性化癌症网络(癌症特异性调控网络);功能基因组学(哺乳动物基因组功能分析、细菌比较基因组学与代谢重构)。
【标志性成果】长期获得德国研究基金会(DFG)及欧盟框架计划(FP6)等多项重大科研资助(含6个计算集群与53个工作站的科学仪器资助)。担任Bioinformatics、NAR Genomics and Bioinformatics等权威期刊编委,以及BioSystems、Amino Acids副主编。长期担任ISMB、PSB、GCB等顶级生物信息学会议程序委员。作为共同创始人兼董事会成员创立Biomax Informatics AG(生物信息学软件公司),兼具学术研究与技术商业化的双重经验,Google Scholar引用量居领域前列。
